Writing for Computer Science (Springer)

Writing for Computer Science - J. Zobel Springer 1997) WW

Writing for computer science students

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Descargar Geo Dataset desde R

Cada Geo Dataset tiene un codigo o identificador unico por ejemplo en esta web puedes navegar el tipo de datos que deseas o de enfermeda,estudio deseas descargar http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds en nuestro caso buscamos Breast cancer relapse free survival y seleccionamos el item con codigo : GSE2034 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE2034 que es el caso de estudio de metástasis de cancer mamario.

Bueno en R tienes que hacer los sgtes pasos:

1. Instalamos la libreria "GEOquery"
biocLite("GEOquery")

pero nos aseguramos que este ya instalado el source de bioconductor

2.referenciamos la libreria
library("GEOquery")

3. Descargamos nuestra data
getGEOSuppFiles('GSE2034')

4. si deseas descomprimirlo desde R :
untar("GSE2034_RAW.tar", exdir="data")

Instalar bioconductor en R

Para instalar bioconductor debes seguir los sgtes pasos.

1. Ejecuta a R como administrador si es en linux (sudo R).
2. Añadimos el script de bioconductor


> source("http://www.bioconductor.org/biocLite.R")


3. Llamamos a la sgte funcion del script instalado

> biocLite()

4. Esperamos a que compile :D

5. Verficamos las nuevas librerias instaladas con

> library()

Instalar paquetes en R

Si estas en linux o windows inicia como administrador a R . Por ejemplo en un linux:

> sudo R

una vez abierto R con permisos de superusuario

> install.packages("nombrepaquete",dependencies=true)

dependencies: es true para q instale automatico otros paquetes del cual depende

por ejemplo queremos instalar lo sgte :

> install.packages("graphics",dependencies=TRUE)

y si queremos instalar una lista de paquetes

install.packages(c("MASS","nnet","survival","splines"),dependencies=TRUE)

Mi último ACM-ICPC

Mi último ACM-ICPC

EL INICIO

Hace ya 2 años atras o más pensé porque si somos una carrera de Ciencia de la Computación porque no participamos en el ACM-ICPC , las respuestas eran obvias:

• Poco interes de personas en ello .
• Poco apoyo para viajar a Lima a participar.
• Entre otras variables más.

Asi q el 2010 me arriesgue con todo a traer una sede a Trujillo para que mi querida Universidad Nacional de Trujillo en especial mi escuela participe :D . Si que fue un trabajo duro en la UNT tanto en la organizacion del concurso del concurso como buscar personas que participen en el evento. Asi que me meti de asistente de cátedra de un curso de Tecnicas de programación ("diseño de algoritmos" en mi U) y deje de llevar un curso =/ ; en los labs les dejaba ejercicios tipo para el concurso .

De esa experiencia rescate un par de personas y con otros amigos del ultimo año formamos el team ACM-ICPC UNT :D .

Como todo inicio siempre es dificil: sin coach, ni apoyo de autoridades ni profes y nadie que un peso x nosotros =( .

Bueno en ese año 2010 todo nos salio con las justas pq también teniamos q organizar un congreso y las mismas personas q estábamos en los teams eramos organizadores del congreso =/ .

Se llevo a cabo todo :D , yo con un stress pro el cual me fui de viaje x 2 semanas porq ya no daba para más .

Este año

Después de nuestra primera experiencia el 2010, los sobrevivientes de aquel entonces eramos 3 a 4 personas , nadie más =/ . Llego un tiempo q solo mi team quedo , por esos momentos pensé esto se cierra =( no da para mas ='( . Pero gracias a Dios x hay se me aparecio un nuevo team , jovén y con proyección a futuro :D .

Así que en unos 3 a 4 meses entrenamos :D , sin coach x un tiempo hasta recibir la ayuda de mi amigo Nils como coach .

Y bueno no entranamos al nivel q deseamos pero ya algo más q el año pasado :D . No tuvimos financiamento de nuestra universidad para remate =/ , en fin pequeños detalles q nos hacen más fuertes :D .

El concurso

Este año lo organizo al Universidad Privada del Norte , algo a destiempo pero se llevo a cabo , con algún u otro inconveniente pero salio :D . La UNT nos presentamos con dos equipos : UNTrainning (mi team) y Time Limit Exced , bueno solo para dos teams nos alcanzo nuestro dinero .

Este año me pareció que el set de problemas estuvo mas complejo q el del 2010 , intentamos 5 de los cuales solo nos acepto dos xD (ya algo es algo ). Y ganamos localmente con aquellos resueltos . Esperaba más pero x A o B motivos no se pudo. Espero que los teams sucesores continuen con la chamba y algún día estemos en la cima :D .

Ocurrencias del ACM-ICPC

Por este concurso me:

• Estresee
• Me endeude el 2010 con 900 lukas :| hasta q me dio el dinero la unt xD .
• Puse n veces de mi bolsillo para q esto corra.
• Di el tiempo que no tenia pero = lo daba.
• Deje de llevar un curso.
• Hasta con la mafia de la unt(autoridades) xD me involucre para financiamiento en el 2010.

Todos pensarán que webon es este q desperdicia tanto de si . Me da = lo que digan xD , me siento satisfecho de ello y lo volvería a realizar y más :D .

Este año ya no representaré a mi querida universidad ( "entre lagrimas :'( " ) , pero di el segundo paso de los 6 q planee para mi U :D , espero que los que se quedan continuen con este trabajo en vez q me agradezcan :D . También espero el sgte año ganarme el puesto de coach , seguiré entrenando :D weno ya no tendré otras ocupaciones como este año .

Mil gracias a Dios por guiarme en esto :D y a todos por su apoyo :D . Consejo : Si piensas esperar que te den todo o te caiga del cielo , estás perdido y vivirás mal a lo largo de tu vida = / . Hasta que tus sueños se conviertan en metas :D .

Por aca unas fotos :

Introductory Statistics with R

Introductory Statistics with R

This book provides an elementary-level introduction to R, targeting both non-statistician scientists in various fields and students of statistics. The main mode of presentation is via code examples with liberal commenting of the code and the output, from the computational as well as the statistical viewpoint. A supplementary R package can be downloaded and contains the data sets.

The statistical methodology includes statistical standard distributions, one- and two-sample tests with continuous data, regression analysis, one- and two-way analysis of variance, regression analysis, analysis of tabular data, and sample size calculations. In addition, the last six chapters contain introductions to multiple linear regression analysis, linear models in general, logistic regression, survival analysis, Poisson regression, and nonlinear regression.

In the second edition, the text and code have been updated to R version 2.6.2. The last two methodological chapters are new, as is a chapter on advanced data handling. The introductory chapter has been extended and reorganized as two chapters. Exercises have been revised and answers are now provided in an Appendix.

Peter Dalgaard is associate professor at the Department of Biostatistics at the University of Copenhagen and has extensive experience in teaching within the PhD curriculum at the Faculty of Health Sciences. He has been a member of the R Core Team since 1997.

You can download in these links:

link 1

link 2

link 3

To download language R , you shoud visit

http://www.r-project.org/