Descargar Geo Dataset desde R

Cada Geo Dataset tiene un codigo o identificador unico por ejemplo en esta web puedes navegar el tipo de datos que deseas o de enfermeda,estudio deseas descargar http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds en nuestro caso buscamos Breast cancer relapse free survival y seleccionamos el item con codigo : GSE2034 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE2034 que es el caso de estudio de metástasis de cancer mamario.

Bueno en R tienes que hacer los sgtes pasos:

1. Instalamos la libreria "GEOquery"
biocLite("GEOquery")

pero nos aseguramos que este ya instalado el source de bioconductor

2.referenciamos la libreria
library("GEOquery")

3. Descargamos nuestra data
getGEOSuppFiles('GSE2034')

4. si deseas descomprimirlo desde R :
untar("GSE2034_RAW.tar", exdir="data")